研究领域：核酸表观遗传修饰的功能与机制

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通讯地址：上海市杨浦区四平路1239号东区大楼A座1004室，开云官方网站登录入口，邮编200092

个人简介：

2012年6月毕业于南京大学，获理学学士学位；2019年1月毕业于中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所，获理学博士学位。2021年在美国希望之城国家医学中心完成博士后训练，并于9月起加入开云官方网站登录入口，担任“青年百人计划”特聘研究员，博士生导师；并担任同济大学附属同济医院双聘研究员。薛剑煌博士长期从事DNA/RNA修饰的动态变化机制及其在发育与疾病中的生物学功能研究，曾以第一作者或通讯作者在Nature、Mol Cell、Cell Stem Cell、Sci Transl Med、Adv Sci、Nucleic Acids Res等杂志发表学术论文，曾获吴瑞奖、中科院优秀博士学位论文等荣誉；入选上海市科技青年35人引领计划、上海市海外高层次人才计划；获国自然面上项目（2项）、国家科技重大专项、国家重点研发计划、上海市面上项目等支持，担任Life Medicine、Mil Med Res杂志青年编委及多个杂志审稿人。

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研究方向：

1. 核酸修饰阅读器的鉴定及其功能与调控机制解析。

2. 新型核酸修饰与修饰酶的发现及其功能与调控机制。

3. 衰老及疾病中核酸修饰的功能机制与靶向干预方案。

研究内容：

DNA修饰是表观遗传学的重要研究内容，本课题组主要关注由酶促反应催化产生的可遗传的DNA修饰的生物学功能与调控机制。真核生物中已知的DNA修饰种类较少，我们将探索自然界中存在的新型DNA修饰及其修饰酶，开发DNA修饰检测工具，解析该修饰产生、去除以及被识别的分子机理，阐述其生物学功能，拓展DNA修饰的研究范围与应用前景。

RNA修饰的种类丰富，mRNA上的不同化学修饰能够在转录后层面对mRNA的可变剪接、出核、降解等过程产生影响。我们将通过鉴定RNA修饰的识别蛋白，深入解析其所发挥的生物学功能与调控机理。

DNA/RNA修饰的动态变化对哺乳动物的生长、发育以及衰老等过程具有极其重要的影响，其异常变化将可能诱发多种疾病。我们将以衰老与肿瘤等疾病为研究模型，探究不同核酸修饰在衰老及相关疾病中的功能与调控机制，为衰老与相关疾病的靶向干预提供科学参考与潜在方案。

      本课题组设备先进、经费充足；课题组常年招聘博士后和研究生，欢迎博士生、硕士生、本科生报考；欢迎同学们前来参观交流或实习。

      课题组旨在创造轻松愉悦的科研氛围，导师与同学们关系融洽，共同成长；希望同学们能够在此取得进步，来时意气风发，去时前程似锦。

代表性论文：(*Co-first authors; #Corresponding authors)

2026：

14.Meng WY*, Xu M*, Sun SX*, Sun ZY*, … Li Y#, Shi J#, Xue JH#. SMD2 reads pseudouridines to regulate mRNA splicing and promote tumorigenesis. Mol Cell. 2026 Aug 20;86(16):3332-3343.e10.

13.Wang Z*, Han C*, Huang Y*, Fu Y*, Hu K*, Huang Z*, … Xue J#, Song Y#, Sun Y#, Ge J#, Zhou C#. Epi-Allele elicits compensatory expression of the non-targeted allele and prevents haploinsufficiency in dominant genetic diseases. Cell Stem Cell. 2026 Sep 3:S1934-5909(26)00305-X.

12.Kang L, … Xue J#, Yan S#. Discriminating single-amino acid differences and post-translational modifications in negatively charged peptides with α-hemolysin nanopores. J Nanobiotechnology. 2026 Jul 21.

11.Yin X*, Zhang H*, Zhang R, Xue J#, Hou Y#. Epigenetic noise in the aging brain: tuning neuronal vulnerability to neurodegeneration. Trends Neurosci. 2026 Jun;49(6):481-499.

10.He BD, Wang FC, Xue JH#. Deaminase-Assisted Sequencing for the Identification of 5-glyceryl-methylcytosine. Bio Protoc. 2026 Feb 20;16(4):e5601.

2025：

9.Wang ZX*, Chen F*, He BD*, … Hou Y#, Shi J#, Xue JH#. Direct Sequencing of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine at Single-Base Resolution Unravels Their Distinct Roles in Alzheimer's Disease. Adv Sci. (Weinh) 2025 Oct;12(38):e07843.

8.Wang FC*, He BD*, … Xue JH#. Base-resolution profiling of 5-glyceryl-methylcytosine in Chlamydomonas reinhardtii via deaminase-assisted sequencing. Nucleic Acids Res. 2025 Sep 23;53(18):gkaf955.

7.Wang L*, He B*, … Xue J#, Yan S#. Accurate Mapping of 5-Glyceryl-methylcytosine Using Nanopore Sequencing. Anal Chem. 2025 May 13;97(18):9992-9999.

6.Zhu Q*, Song Y*, Qian Y*, … Xue J#, Hou Y#. Targeting glial dysfunction in Alzheimer’s disease: insights into pathogenesis and emerging therapeutics. Ageing Neur Dis. 2025;5:19.

2024：

5.Meng WY*, Wang ZX*, … Hou Y#, Xue JH#. Epigenetic marks or not? The discovery of novel DNA modifications in eukaryotes. J Biol Chem. 2024 Apr;300(4):106791.

2023：

4.Chen Z*, Zhou K*, Xue J*, Small A*, … Chen J#, Deng X#. Phosphorylation stabilized TET1 acts as an oncoprotein and therapeutic target in B-cell acute lymphoblastic leukemia. Sci Transl Med. 2023 Mar 29;15(689):eabq8513.

Before 2021:

3.Xue JH*, Chen GD*, Hao F*, Chen H*, … Huang K#, Tang H#, Xu GL#. A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue. Nature 2019 May;569(7757):581-585.

2.Xue JH*, Xu GF*, … Du YR#. Uracil-DNA Glycosylase UNG Promotes Tet-mediated DNA Demethylation. J Biol Chem. 2016 Jan 8;291(2):731-8.

1.Xue JH, Xu GL#. RNA Pol II as a sensor of 5caC. Cell Res 2015 Oct;25(10):1089-90.